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中國人自己的單細胞測序儀來了!
發布時間:2018-06-27 來源: 編輯:admin
過去兩年有一項大熱的技術,大量研究人員通過這項技術解決重要科學問題,發表了大量高水平學術文章,這項技術便是單細胞測序技術。
 
單細胞測序技術,在這兩年得到了蓬勃發展。一些高通量的單細胞測序平臺開始為大家所熟知。有10×genomics單細胞測序平臺、以及Fluidigm、WaferGen、Illumina/Bio-Rad等。
這些平臺在很大程度上降低了單細胞測序的成本,使得單個細胞的測序成本變得極低。雖然單個細胞的成本降低了,但一個樣本需要產生大量細胞的數據,所以單個樣本的成本并沒有很低。大多數的研究者會因這幾十萬甚至上百萬的測序成本而對單細胞測序研究望而卻步。有些希望從事單細胞研究或者希望提供單細胞測序服務的單位,也會因為測序平臺高昂的價格而猶豫不決。

大家所熟知的10×genomics單細胞胞測序平臺依托的技術手段稱之為inDrop-seq,論文在2015年發表與Cell雜志。該方法利用微液滴技術將帶有條形碼、索引分子、引物及其他的凝膠珠與單細胞混合。每個液滴內開展逆轉錄反應,以產生測序所用的帶有條形碼的cDNA。
 
10×genomics單細胞測序平臺原理圖
有意思的是,凈信使用的Drop-seq技術與inDrop-seq技術發表與同一期的Cell雜志上。Drop-seq也是利用微流控技術將細胞分開,并與帶有特定條形碼的磁珠混合。磁珠上的Poly(dT)將細胞內的信使RNA捕獲。收集磁珠凈信逆轉錄和擴增,得到測序所用的帶有條形碼的cDNA。與inDrop-seq不同的是,Drop-seq的逆轉錄的過程是在液滴外進行的,這樣逆轉錄的效率會更高。
 
凈信單細胞測序儀原理圖

 
凈信單細胞測序儀 樣機圖
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